Die Rolle von Chromatinmodulatoren und DNA Reparaturfaktoren während der Etablierung und Erhaltung der Latenz von Gammaherpesviren

Nukleare Strukturen, gebildet von KSHV LANA, so genannte LANA speckles

Kaposi-Sarkom zeigt sich auf der Haut und inneren Organen vieler Aids-Patienten. Im Film „Philadelphia“ zum Beispiel, entdeckt der HIV-erkrankte Andrew eines Tages erschrocken einen dunklen Fleck in seinem Gesicht. Auslöser dieser Hautveränderung ist der Ausbruch des Kaposi-Sarkom-Herpesvirus (KSHV). Es verursacht nicht nur hässliche Flecken auf der Haut, sondern kann in inneren Organen zu Blutungen führen. Diese Blutungen gehören zu den häufigsten Todesursachen bei Aidspatienten. Dabei ist KSHV, wie die meisten Herpesviren, für Gesunde nicht gefährlich. Unbemerkt ruht es in unseren Zellen. Ist aber das Immunsystem geschwächt, kann der Körper sich nicht immer gegen einen Ausbruch des Virus wehren. Die Arbeitsgruppe um Thomas Schulz möchte die Mechanismen klären, mit denen Kaposi-Sarkom Viren sich dauerhaft im Menschen festsetzen und später wieder aktiv werden. Dabei konzentrieren sich die Wissenschaftler auf die Phase kurz nach dem Eindringen des Erregers. Dann nämlich schleusen die Viren ihr Erbgut in den Kern der Zellen ein. Das sorgt dafür, dass das Virusgenom unentdeckt bleibt und sich bei der Zellteilung so vervielfacht, als wäre es ein Teil der körpereigenen Erbanlagen. Um sein Genom in den Zellen zu stabilisieren, produziert KSHV ein Protein namens LANA (Latency Associated Nuclear Antigen). LANA trägt außerdem dazu bei, infizierte Zellen so zu programmieren, dass sie sich vermehren und gleichzeitig das Virus in ihrem Inneren vor dem Immunsystem verbergen. Die Wissenschaftler untersuchen die Interaktion von LANA mit Proteinen der menschlichen Zellen auf der Suche nach einem Angriffspunkt, um die Ansiedlung und Vermehrung des Virus zu verhindern. Um die Infektion direkt im Körper beobachten zu können, arbeiten die Forscher auch mit einem Mäusevirus, welches ein LANA-ähnliches Protein besitzt. So können sie Labormäuse gezielt mit veränderten Viren infizieren, und den Verlauf der Infektion untersuchen.

Mitglieder der Krebs verursachenden lymphotropen Gammaherpesviren – beim Menschen sind dies das Epstein-Barr Virus (EBV) und das Kaposi Sarkom Herpesvirus/humane Herpesvirus 8 (KSHV/HHV8) ‑ sowie die epitheliotropen Papillomaviren etablieren ihre Latenz in sich teilenden Zellen. Deshalb verfügen sie über einen Mechanismus, der für die Replikation des latenten zirkulären (episomalen) viralen Genoms in der S-Phase und die kontrollierte Verteilung der replizierten Episomen auf die Tochterzellen während der Mitose sorgt. Ferner erfolgt in den latent infizierten Zellen eine auf wenige virale Gene beschränkte Genexpression.

Wissenschaftliche Vorgehensweise

Ziel des Projekts C1 ist es, die Persistenz von latenten KSHV Genomen auf der molekularen Ebene zu verstehen und auf dieser Basis mögliche Angriffspunkte für eine eventuelle pharmakologische Intervention zu identifizieren. Bei diesen Prozessen kommt dem KSHV LANA Protein (Latency-Associated Nuclear Antigen) eine besondere Bedeutung zu. LANA ist für die latente Replikation der viralen DNA essentiell, bindet latente virale Genome an das Chromatin der Wirtszelle und stellt damit sicher, dass diese während der Zellteilung wie ein zusätzliches Chromosom auf Tochterzellen verteilt werden. Im Projekt C1 durchgeführte Arbeiten führten zu einer Aufklärung der molekularen Struktur der mit der viralen DNA interagierenden c-terminalen Domäne dieses Proteins und erlaubten die Entwicklung eines Modells, wie LANA virale DNA-Chromatin Komplexe assembliert (Hellert et al., PLoS Pathogens 2013; Proc. Natl. Acad. Sci. 2015). Zur Zeit laufende Untersuchungen betreffen die Interaktion von LANA mit den Mitgliedern der zellulären Brd/BET Protein Familie, welche bestimmte epigenetische Modifikationen (Histonazetylierungen) auf Histonen erkennen.

Diese Interaktion könnte eine Rolle bei der präferentiellen Assoziation von LANA mit zellulären Promotoren spielen und damit entweder der Regulation zellulärer Gene durch LANA oder der Positionierung von latenten viralen Genomen in ‚aktiven’ Chromatinregionen dienen. Überraschenderweise konnten wir in den letzten Jahren zeigen, dass zytoplasmatische Varianten von LANA eine Rolle bei der Hemmung des angeborenen Immunsystems spielen und damit dafür sorgen, dass virale DNA nicht ‚versehentlich’ von dem DNA Sensor cGAS, welcher die Aktivierung des Interferonsystems auslöst, oder dem DNA Doppelstrangbruch Erkennungssystem MRN (Mre11, Rad50, Nbs1), welches die Aktivierung des NFkB Signalwegs initiiert, erkannt wird (Zhang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 2016; Mariggiò et al. PLoS Pathogens 2017). Zusammengefasst deuten unsere bisherigen Befunde darauf hin, dass LANA eine Rolle bei der Assemblierung, Replikation und Abschirmung viraler DNA gegenüber dem angeborenen Immunsystem spielt.

Thomas Schulz erzählt über seine Forschung im SFB 900

Thomas Schulz ist der Gründer und Sprecher des SFB 900. In seinem Teilprojekt C1 geht es um die Persistenz der Kaposi Sarkom Herpesviren. Er und seine Forschergruppe möchten aufklären, wie die Viren dauerhaft im Körper während der Latenzphase verweilen können und wie sie wieder aktiviert werden.

Publikationen des Forschungsprojektes C1

  • Case Report: Convalescent Plasma Therapy Induced Anti-SARSCoV-2 T Cell Expansion, NK Cell Maturation and Virus Clearance in a B Cell Defcient Patient After CD19 CAR T Cell Therapy. Bosnjak B, Odak I, Ritter C, Stahl K, Graalmann T, Steinbrück L, Blasczyk R, Falk CS, Schulz TF, Wedemeyer HH, Cornberg M, Ganser A, Förster R and Koenecke C Front. Immunol. 2021 Aug 12; 12:721738.
  • Evaluating assembly and variant calling software for strain-resolved analysis of large DNA viruses. Deng Z-L, Dhingra A, Fritz A, Götting J, Münch PC, Steinbrück L, Schulz TF, Ganzenmüller T, McHardy AC. Brief Bioinform 2021 ; 22; 3
  • 3D culture conditions support Kaposi’s sarcoma herpesvirus (KSHV) maintenance and viral spread in endothelial cells. Dubich T, Dittrich A, Bousset K, Geffers R, Büsche G, Köster M, Hauser H, Schulz TF, Wirth D. J Mol Med (Berl) 2021 ; 99; 3
  • Recent Advances in Developing Treatments of Kaposi’s Sarcoma Herpesvirus-Related Diseases. Naimo E, Zischke J, Schulz TF. Viruses 2021; 13; 9
  • Tracking the international spread of SARS-CoV-2 lineages B.1.1.7 and B.1.351/501Y-V2 with grinch. O’Toole Á, Hill V, Pybus OG, Watts A, Bogoch II, Khan K, Messina JP, Tegally H, Lessells RR, Giandhari J, Pillay S, Tumedi KA, Nyepetsi G, Kebabonye M, Matsheka M, Mine M, Tokajian S, Hassan H, Salloum T, Merhi G, Koweyes J, Geoghegan JL, de Ligt J, Ren X, Storey M, Freed NE, Pattabiraman C, Prasad P, Desai AS, Vasanthapuram R, Schulz TF, Steinbrück L, Stadler T, Parisi A, Bianco A, García de Viedma D, Buenestado-Serrano S, Borges V, Isidro J, Duarte S, Gomes JP, Zuckerman NS, Mandelboim M, Mor O, Seemann T, Arnott A, Draper J, Gall M, Rawlinson W, Deveson I, Schlebusch S, McMahon J, Leong L, Lim CK, Chironna M, Loconsole D, Bal A, Josset L, Holmes E, St George K, Lasek-Nesselquist E, Sikkema RS, Oude Munnink B, Koopmans M, Brytting M, Sudha Rani V, Pavani S, Smura T, Heim A, Kurkela S, Umair M, Salman M, Bartolini B, Rueca M, Drosten C, Wolff T, Silander O, Eggink D, Reusken C, Vennema H, Park A, Carrington C, Sahadeo N, Carr M, Gonzalez G, de Oliveira T, Faria N, Rambaut A,Kraemer MUG. Wellcome Open Res 2021 ; 6
  • Brd/BET Proteins Influence the Genome-Wide Localization of the Kaposi’s Sarcoma-Associated Herpesvirus and Murine Gammaherpesvirus Major Latency Proteins. Lotke R, Schneeweiß U, Pietrek M ,Günther T , Grundhoff A, Weidner-Glunde M, Schulz TF. Front Microbiol. 2020 Oct 22 11:591778.
  • Quantitative Proteomics Analysis of Lytic KSHV Infection in Human Endothelial Cells Reveals Targets of Viral Immune Modulation. Gabaev I, Williamson JC, Crozier TWN, Schulz TF, Lehner PJ. Cell Rep. 2020 Oct 13 ;33(2):108249.
  • Hit-to-lead optimization of a latency-associated nuclear antigen inhibitor against Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus infections.Kirsch P, Stein SC, Berwanger A, Rinkes J, Jakob V, Schulz TF, Empting M. Eur J Med Chem. 2020 Sep 15 ;202:112525.
  • Whole-Genome Approach to Assessing Human Cytomegalovirus Dynamics in Transplant Patients Undergoing Antiviral Therapy.Suárez NM, Blyth E, Li K, Ganzenmueller T, Camiolo S, Avdic S, Withers B, Linnenweber-Held S, Gwinner W, Dhingra A, Heim A, Schulz TF, Gunson R, Gottlieb D, Slobedman B, Davison AJ. Front Cell Infect Microbiol. 2020 Jun 15 ;10:267.
  • Discovery of Novel Latency-Associated Nuclear Antigen Inhibitors as Antiviral Agents Against Kaposi’s Sarcoma-Associated Herpesvirus. Kirsch P, Jakob V, Elgaher WAM, Walt C ,Oberhausen K, Schulz TF, Empting M. ACS Chem Biol. 2020 Feb 21;15(2):388-395. Epub 2020 Jan 24.
  • Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus vIRF2 protein utilizes an IFN-dependent pathway to regulate viral early gene Expression. Koch S, Damas M, Freise M, Hage E, Dhingra A, Rückert J, Gallo A, Kremmer E, Tegge W, Brönstrup M, Brune W, Schulz TF. PLOS Pathogens May 6, 2019; 49(5):686-693

  • Fragment-Based Discovery of a Qualified Hit Targeting the Latency-Associated Nuclear Antigen of the Oncogenic Kaposi’s Sarcoma-Associated Herpesvirus/Human Herpesvirus 8. Kirsch P , Jakob V , Oberhausen K , Stein SC, Cucarro I, Schulz TF, Empting M. J Med Chem. 2019 Apr 25;62(8):3924-3939. Epub 2019 Apr 12.
  • An Endothelial Cell Line Infected by Kaposi’s Sarcoma-Associated Herpes Virus (KSHV) Allows the Investigation of Kaposi’s Sarcoma and the Validation of Novel Viral Inhibitors in Vitro and in Vivo. Dubich T , Lieske A , Santag S , Beauclair G , Rückert J , Herrmann J , Gorges J , Büsche G , Kazmaier U , Hauser H , Stadler M , Schulz TF , Wirth D. J Mol Med (Berl). 2019 Mar;97(3):311-324. Epub 2019 Jan 4.
  • The Kaposi’s Sarcoma-Associated Herpesvirus (KSHV) Non-Structural Membrane Protein K15 Is Required for Viral Lytic Replication and May Represent a Therapeutic Target. Abere B, Mamo TM, Hartmann S , Samarina N , Hage E, Rückert J , Hotop SK, Büsche G , Schulz TF. PLoS Pathog. 2017 Sep 22;13(9):e1006639.
  • Kaposi’s Sarcoma Herpesvirus Latency-Associated Nuclear Antigen (LANA): Replicating and Shielding Viral DNA during Viral Persistence. Weidner-Glunde M, Mariggiò G, Schulz TF. J Virol. 2017 Jun 26;91(14).

  • Kaposi Sarcoma Herpesvirus (KSHV) Latency-Associated Nuclear Antigen (LANA) recruits components of the MRN (Mre11-Rad50-NBS1) repair complex to modulate an innate immune signaling pathway and viral latency. Mariggiò G, Koch S, Zhang G, Weidner-Glunde M, Rückert J, Kati S, Santag S, Schulz TF. PLoS Pathog. 2017 Apr 21;13(4):e1006335.

  • Proliferation status defines functional properties of endothelial cells. Lipps C, Badar M, Butueva M, Dubich T, Singh VV, Rau S, Weber A, Kracht M, Köster M, May T, Schulz TF, Hauser H, Wirth D. Cell Mol Life Sci. 2016 Nov 16.

  • Genome-wide analysis of chromosomal import patterns after natural transformation of Helicobacter pylori. Bubendorfer S, Krebes J, Yang I, Hage E, Schulz TF, Bahlawane C, Didelot X, Suerbaum S. Nat Commun. 2016 Jun 22;7:11995.

  • Cytoplasmic isoforms of Kaposi sarcoma herpesvirus LANA recruit and antagonize the innate immune DNA sensor cGAS. Zhang G, Chan B, Samarina N, Abere B, Weidner-Glunde M, Buch A, Pich A, Brinkmann MM, Schulz TF. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Jan 25. pii: 201516812.

  • Genome-wide Profiling Reveals Remarkable Parallels Between Insertion Site Selection Properties of the MLV Retrovirus and the piggyBac Transposon in Primary Human CD4+ T Cells. Gogol-Döring A, Ammar I, Gupta S, Bunse M, Miskey C, Chen W, Uckert W, Schulz TF, Izsvák Z, Ivics Z. Mol Ther. 2016 Jan 12.

  • Generation of high-titre virus stocks using BrK.219, a B-cell line infected stably with recombinant Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus. Kati S, Hage E, Mynarek M, Ganzenmueller T, Indenbirken D, Grundhoff A, Schulz TF. J Virol Methods. 2015 Jun 1;217:79-86.

  • The 3D structure of Kaposi sarcoma herpesvirus LANA C-terminal domain bound to DNA. Hellert J, Weidner-Glunde M, Krausze J, Lünsdorf H, Ritter C, Schulz TF, Lührs T. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 May 26;112(21):6694-9.

  • The role of Kaposi sarcoma-associated herpesvirus in the pathogenesis of Kaposi sarcoma. Gramolelli S, Schulz TF. J Pathol. 2015 Jan;235(2):368-80. Review.

  • Bromo- and extraterminal domain chromatin regulators serve as cofactors for murine leukemia virus integration. Gupta SS, Maetzig T, Maertens GN, Sharif A, Rothe M, Weidner-Glunde M, Galla M, Schambach A, Cherepanov P, Schulz TF. J Virol. 2013 Dec;87(23):12721-36.

  • A structural basis for BRD2/4-mediated host chromatin interaction and oligomer assembly of Kaposi sarcoma-associated herpesvirus and murine gammaherpesvirus LANA proteins. Hellert J, Weidner-Glunde M, Krausze J, Richter U, Adler H, Fedorov R, Pietrek M, Rückert J, Ritter C, Schulz TF, Lührs T. PLoS Pathog. 2013;9(10):e1003640.

  • Activation of the B cell antigen receptor triggers reactivation of latent Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus in B cells. Kati S, Tsao EH, Günther T, Weidner-Glunde M, Rothämel T, Grundhoff A, Kellam P, Schulz TF. J Virol. 2013 Jul;87(14):8004-16.

  • The ubiquitin-specific protease USP7 modulates the replication of Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus latent episomal DNA. Jäger W, Santag S, Weidner-Glunde M, Gellermann E, Kati S, Pietrek M, Viejo-Borbolla A, Schulz TF. J Virol. 2012 Jun;86(12):6745-57.

  • Recruitment of the tumour suppressor protein p73 by Kaposi Sarcoma Herpesvirus latent nuclear antigen contributes to the survival of primary effusion lymphoma cells. Santag S, Jäger W, Karsten CB, Kati S, Pietrek M, Steinemann D, Sarek G, Ojala PM, Schulz TF. Oncogene, 2012, 1-10.

  • A role for the internal repeat of the Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus latent nuclear antigen in the persistence of an episomal viral genome. Alkharsah KR, Schulz TF. J Virol. 2012 Feb;86(3):1883-7.

Kontakt

Prof. Dr. med. Thomas F. Schulz

Institut für Virologie
Medizinische Hochschule Hannover
Carl-Neuberg-Str. 1
30625 Hannover

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