Die angeborenen und erworbenen Mechanismen des Immunsystems spielen eine zentrale Rolle bei der Kontrolle von chronischen Infektionen. Viele pathogene Erreger haben andererseits Mechanismen entwickelt, mit denen sie Komponenten des Immunsystems entkommen können. Wichtige Aspekte dieses Wechselspiels zwischen Erreger und Wirt während der Etablierung einer chronischen Infektion werden im Projektbereich B untersucht.

Ein besonderer Schwerpunkt liegt auf den – grundsätzlich persistierenden – Herpesviren. Die Bearbeitung von viralen und bakteriellen Erregern in einem infektionsimmunologischen Ansatz dient dazu, Gemeinsamkeiten zwischen Erregern aufzuzeigen.